Le Collège est dirigé par le Père Supérieur assisté par un Conseil de Direction formé par les Préfets des différents Cycles. Les responsabilités de ce Conseil consistent à assurer le bon fonctionnement du Collège sur le plan organisationnel et relationnel et de décider des mesures propres au maintien d’une ambiance éducative conforme à l’esprit du Collège.

 Le Conseil de Direction a le souci d’harmoniser l’action des Préfets de Cycle sur les plans de l’éducation, de l’enseignement, des méthodes de travail ainsi que de l’organisation générale de la vie du Collège: bonne application du règlement, organisation des manifestations religieuses, culturelles, sociales ou sportives, des activités parascolaires, des réunions des parents, etc...Chaque Cycle est dirigé par un Préfet chargé de l’organisation générale du Cycle et de son fonctionnement sur tous les plans et notamment sur ceux de l’administration, des études et de la discipline.

Les Préfets de Cycle, clefs de voûte de la vie de leur Cycle, sont nommés par le Père Supérieur dont ils sont les collaborateurs directs et qu’ils représentent dans leur Cycle.Pour ce qui a trait aux méthodes de travail, au curriculum académique et au système d’évaluation, les Préfets de Cycle et les professeurs des différentes matières sont assistés par des Coordonnateurs pédagogiques qui sont également chargés de la formation continue des enseignants. Les Coordonnateurs pédagogiques et les Préfets de Cycle sont membres de droit du Conseil Pédagogique du Collège présidé par le Père Supérieur. La fonction dudit Conseil est de définir les grandes orientations pédagogiques de l’Etablissement et d’en suivre l’exécution à tous les niveaux.